Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMER3Q8N944 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms