Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VWDEQ8N2E2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VWDEQ8N2E2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
VWDEQ8N2E2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms