Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP3Q8IZU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms