Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLX4Q8IY92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLX4Q8IY92 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX4Q8IY92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLX4Q8IY92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLX4Q8IY92 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLX4Q8IY92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms