Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOT1Q8IXI2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOT1Q8IXI2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms