Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
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