Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMB4Q86W47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMB4Q86W47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms