Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPNS3Q6ZMD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPNS3Q6ZMD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPNS3Q6ZMD2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPNS3Q6ZMD2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPNS3Q6ZMD2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms