Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC5Q6UXY8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC5Q6UXY8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms