Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms