Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF17Q5VTA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF17Q5VTA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms