Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C10orf55Q5SWW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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C10orf55Q5SWW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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C10orf55Q5SWW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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C10orf55Q5SWW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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C10orf55Q5SWW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C10orf55Q5SWW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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