Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1Q5M775 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPECC1Q5M775 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPECC1Q5M775 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1Q5M775 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1Q5M775 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms