Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI8

RABL3, Rab-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL3Q5HYI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABL3Q5HYI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABL3Q5HYI8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABL3Q5HYI8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABL3Q5HYI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABL3Q5HYI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms