Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFDP3Q5H9I0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFDP3Q5H9I0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms