Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO48Q5FWF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO48Q5FWF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO48Q5FWF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms