Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRNQ16849 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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