Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF239Q16600 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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