Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPC1Q16533 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAPC1Q16533 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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