Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA4Q16363 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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