Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERPUD1Q15011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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