Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 HDLBP-209ENST00000422933 929 ntTSL 39.74□□□□□ -0.858e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 46.07□□□□□ -1.449e-31■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.975e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-203ENST00000597209 662 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-202ENST00000596708 687 ntTSL 311.53□□□□□ -0.562e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 CHMP2A-205ENST00000600006 766 ntTSL 28.21□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 221.95■■□□□ 1.14e-10■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.314e-10■■■□□ 17.1
PUM1Q14671 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 214.12□□□□□ -0.157e-9■■■□□ 17
PUM1Q14671 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 MAP1LC3B-208ENST00000570189 1259 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 CREBBP-203ENST00000570939 3316 ntTSL 58.75□□□□□ -1.017e-8■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-218ENST00000527118 700 ntTSL 316.46■□□□□ 0.231e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-215ENST00000524393 583 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-217ENST00000526193 568 ntTSL 49.14□□□□□ -0.951e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 RBBP4-214ENST00000492348 1547 ntTSL 26.63□□□□□ -1.351e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 28.46□□□□□ -1.062e-16■■■□□ 17
PUM1Q14671 HSP90AA1-210ENST00000560130 488 ntTSL 25.49□□□□□ -1.531e-36■■■□□ 17
PUM1Q14671 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC9.45□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.782e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 529.66■■■□□ 2.342e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 528.2■■■□□ 2.12e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-206ENST00000439994 671 ntTSL 525.28■■□□□ 1.642e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 324.14■■□□□ 1.455e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 321.92■■□□□ 1.13e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-207ENST00000460939 1770 ntTSL 521.63■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.552e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-203ENST00000394776 2818 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 17
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PUM1Q14671 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 416.51■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 KRT8-207ENST00000546921 542 ntTSL 415.87■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 17
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PUM1Q14671 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-204ENST00000585782 505 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 NCK2-204ENST00000425756 494 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP22-205ENST00000478443 1071 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-205ENST00000586003 367 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KRT8-214ENST00000551318 507 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 KRT8-212ENST00000549198 592 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 PYGL-203ENST00000530336 1459 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 213.58□□□□□ -0.242e-7■■■□□ 17
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PUM1Q14671 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.375e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.444e-25■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-206ENST00000580410 474 ntTSL 412.26□□□□□ -0.454e-25■■■□□ 17
PUM1Q14671 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SART3-206ENST00000546815 2318 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-25■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-25■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.725e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 210.2□□□□□ -0.784e-25■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.815e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 39.93□□□□□ -0.825e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 49.13□□□□□ -0.955e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 ACTN1-212ENST00000554158 571 ntTSL 49.09□□□□□ -0.955e-6■■■□□ 17
PUM1Q14671 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.132e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-25■■■□□ 17
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