Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE7AQ13946 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7AQ13946 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7AQ13946 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7AQ13946 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE7AQ13946 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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