Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC1Q13547 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC1Q13547 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
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