Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 48.43□□□□□ -1.062e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 48.03□□□□□ -1.122e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 47.79□□□□□ -1.162e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 26.14□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 45.21□□□□□ -1.582e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 CTBP1-218ENST00000515690 858 ntTSL 38.27□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 13.8
SRSF9Q13242 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.92e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 313.37□□□□□ -0.273e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-209ENST00000586555 716 ntTSL 212.72□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 212.68□□□□□ -0.383e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-220ENST00000588917 1087 ntTSL 212.13□□□□□ -0.473e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 211.96□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.553e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-245ENST00000621399 1044 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 311.36□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 511.36□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 211.18□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 311.09□□□□□ -0.633e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-203ENST00000444172 584 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 510.44□□□□□ -0.743e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 37.55□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 46.42□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.982e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 412.98□□□□□ -0.338e-12■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.236e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.496e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 216.37■□□□□ 0.217e-11■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.237e-11■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 313.49□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.337e-11■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 412.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-207ENST00000529543 2142 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GTF2H4-204ENST00000475845 659 ntTSL 211.88□□□□□ -0.517e-11■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GTF2H4-205ENST00000483318 1082 ntTSL 211.88□□□□□ -0.517e-11■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-205ENST00000473629 1634 ntTSL 511.8□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-206ENST00000447406 1146 ntTSL 511.55□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 411.37□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 211.37□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 411.37□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-208ENST00000530731 1571 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-210ENST00000492703 726 ntTSL 510.79□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-205ENST00000438549 631 ntTSL 59.72□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 GGT7-204ENST00000470952 427 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-210ENST00000475329 544 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-208ENST00000473615 2075 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-201ENST00000284290 4468 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.962e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-210ENST00000531667 552 ntTSL 48.93□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-209ENST00000480153 2447 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.042e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-204ENST00000452080 730 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 REC8-212ENST00000619469 2720 ntTSL 28.19□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 TBRG1-203ENST00000441174 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 REC8-201ENST00000557806 635 ntTSL 47.94□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.392e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 DSN1-202ENST00000373740 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 35.72□□□□□ -1.492e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-248ENST00000523675 650 ntTSL 35.25□□□□□ -1.572e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 45.01□□□□□ -1.612e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.612e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 44.95□□□□□ -1.622e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 44.86□□□□□ -1.632e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 44.75□□□□□ -1.652e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-232ENST00000521395 540 ntTSL 44.7□□□□□ -1.662e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 44.63□□□□□ -1.672e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.742e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 42.84□□□□□ -1.952e-7■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 CHRD-215ENST00000485883 568 ntTSL 412.6□□□□□ -0.399e-9■■□□□ 13.7
SRSF9Q13242 QRICH2-202ENST00000447564 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.33□□□□□ -0.767e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-7■■□□□ 13.6
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