RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515690.1

CTBP1-218, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 858 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-218ENST00000515690 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.3■■■□□ 2.92
CTBP1-218ENST00000515690 ABCC9O60706 1549 aa29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-218ENST00000515690 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-218ENST00000515690 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.45■■■□□ 2.15
CTBP1-218ENST00000515690 NACADO15069 1562 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-218ENST00000515690 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-218ENST00000515690 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.04■■■□□ 2.08
CTBP1-218ENST00000515690 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-218ENST00000515690 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-218ENST00000515690 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.74■■■□□ 2.03
CTBP1-218ENST00000515690 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
CTBP1-218ENST00000515690 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CTBP1-218ENST00000515690 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.54■■■□□ 2
CTBP1-218ENST00000515690 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
CTBP1-218ENST00000515690 SCRIBQ14160 1630 aa27.17■■□□□ 1.94
CTBP1-218ENST00000515690 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.98■■□□□ 1.91
CTBP1-218ENST00000515690 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-218ENST00000515690 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-218ENST00000515690 NCAPD3P42695 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
CTBP1-218ENST00000515690 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.01■■□□□ 1.75
CTBP1-218ENST00000515690 SMARCA4P51532 1647 aa25.95■■□□□ 1.74
CTBP1-218ENST00000515690 SMARCA2P51531 1590 aa25.94■■□□□ 1.74
CTBP1-218ENST00000515690 HMGXB3Q12766 1538 aa25.88■■□□□ 1.73
CTBP1-218ENST00000515690 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CTBP1-218ENST00000515690 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.81■■□□□ 1.72
CTBP1-218ENST00000515690 ERCC6Q03468 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
CTBP1-218ENST00000515690 CUX2O14529 1486 aa25.79■■□□□ 1.72
CTBP1-218ENST00000515690 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CTBP1-218ENST00000515690 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.73■■□□□ 1.71
CTBP1-218ENST00000515690 NESP48681 1621 aa25.64■■□□□ 1.7
CTBP1-218ENST00000515690 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.64■■□□□ 1.69
CTBP1-218ENST00000515690 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.51■■□□□ 1.67
CTBP1-218ENST00000515690 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.38■■□□□ 1.65
CTBP1-218ENST00000515690 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTBP1-218ENST00000515690 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.32■■□□□ 1.64
CTBP1-218ENST00000515690 WIZO95785 1651 aa25.31■■□□□ 1.64
CTBP1-218ENST00000515690 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
CTBP1-218ENST00000515690 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTBP1-218ENST00000515690 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.13■■□□□ 1.61
CTBP1-218ENST00000515690 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
CTBP1-218ENST00000515690 CFTRP13569 1480 aa25.02■■□□□ 1.6
CTBP1-218ENST00000515690 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.02■■□□□ 1.6
CTBP1-218ENST00000515690 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTBP1-218ENST00000515690 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25■■□□□ 1.59
CTBP1-218ENST00000515690 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CTBP1-218ENST00000515690 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.75■■□□□ 1.55
CTBP1-218ENST00000515690 PRDM2Q13029 1718 aa24.71■■□□□ 1.55
CTBP1-218ENST00000515690 OSCARQ8IYS5 282 aa24.65■■□□□ 1.54
CTBP1-218ENST00000515690 TRIM41Q8WV44 630 aa24.62■■□□□ 1.53
CTBP1-218ENST00000515690 IFT140Q96RY7 1462 aa24.55■■□□□ 1.52
CTBP1-218ENST00000515690 ABCC8Q09428 1581 aa24.53■■□□□ 1.52
CTBP1-218ENST00000515690 TOPBP1Q92547 1522 aa24.52■■□□□ 1.52
CTBP1-218ENST00000515690 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CTBP1-218ENST00000515690 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.43■■□□□ 1.5
CTBP1-218ENST00000515690 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTBP1-218ENST00000515690 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTBP1-218ENST00000515690 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTBP1-218ENST00000515690 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.477e-7■■□□□ 14.1
CTBP1-218ENST00000515690 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
CTBP1-218ENST00000515690 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
CTBP1-218ENST00000515690 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
CTBP1-218ENST00000515690 SOGA1O94964 1423 aa24.19■■□□□ 1.46
CTBP1-218ENST00000515690 ARHGEF11O15085 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
CTBP1-218ENST00000515690 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.18■■□□□ 1.46
CTBP1-218ENST00000515690 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 CHD1O14646 1710 aa24.13■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 FBLN2P98095 1184 aa24.12■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.12■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 WDR97A6NE52 1622 aa24.09■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 CUX1P39880 1505 aa24.08■■□□□ 1.45
CTBP1-218ENST00000515690 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.04■■□□□ 1.44
CTBP1-218ENST00000515690 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CTBP1-218ENST00000515690 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24■■□□□ 1.43
CTBP1-218ENST00000515690 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTBP1-218ENST00000515690 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTBP1-218ENST00000515690 GRIN2BQ13224 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
CTBP1-218ENST00000515690 ARAP1Q96P48 1450 aa23.94■■□□□ 1.42
CTBP1-218ENST00000515690 SYNJ2O15056 1496 aa23.89■■□□□ 1.42
CTBP1-218ENST00000515690 SYNJ1O43426 1573 aa23.89■■□□□ 1.41
CTBP1-218ENST00000515690 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
CTBP1-218ENST00000515690 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
CTBP1-218ENST00000515690 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-218ENST00000515690 PBRM1Q86U86 1689 aa23.82■■□□□ 1.4
CTBP1-218ENST00000515690 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.79■■□□□ 1.4
CTBP1-218ENST00000515690 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
CTBP1-218ENST00000515690 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CTBP1-218ENST00000515690 TOP2BQ02880 1626 aa23.7■■□□□ 1.39
CTBP1-218ENST00000515690 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.7■■□□□ 1.38
CTBP1-218ENST00000515690 GRIN2AQ12879 1464 aa23.65■■□□□ 1.38
CTBP1-218ENST00000515690 ADAMTS12P58397 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
CTBP1-218ENST00000515690 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.59■■□□□ 1.37
CTBP1-218ENST00000515690 NUP160Q12769 1436 aa23.59■■□□□ 1.37
CTBP1-218ENST00000515690 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.57■■□□□ 1.36
CTBP1-218ENST00000515690 CEP170Q5SW79 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
CTBP1-218ENST00000515690 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.48■■□□□ 1.35
CTBP1-218ENST00000515690 SHROOM2Q13796 1616 aa23.45■■□□□ 1.34
CTBP1-218ENST00000515690 JPH4Q96JJ6 628 aa23.38■■□□□ 1.33
CTBP1-218ENST00000515690 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTBP1-218ENST00000515690 IGF1RP08069 1367 aa23.28■■□□□ 1.32
CTBP1-218ENST00000515690 KIF27Q86VH2 1401 aa23.28■■□□□ 1.32
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