Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNMA1Q12791 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMA1Q12791 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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