Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDSRQ06136 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDSRQ06136 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDSRQ06136 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms