Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIN1Q05586 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN1Q05586 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms