Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUCB1Q02818 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUCB1Q02818 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms