Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXK2Q01167 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXK2Q01167 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXK2Q01167 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXK2Q01167 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXK2Q01167 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms