Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXC5Q00444 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms