Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPS1P60891 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPS1P60891 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms