Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD2BP57060 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD2BP57060 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD2BP57060 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms