Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSCP56915 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSCP56915 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSCP56915 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSCP56915 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSCP56915 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GSCP56915 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSCP56915 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSCP56915 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSCP56915 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSCP56915 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSCP56915 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSCP56915 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSCP56915 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSCP56915 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSCP56915 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSCP56915 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSCP56915 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSCP56915 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSCP56915 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSCP56915 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSCP56915 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSCP56915 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSCP56915 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms