Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF10P55107 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF10P55107 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF10P55107 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF10P55107 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF10P55107 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF10P55107 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF10P55107 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF10P55107 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF10P55107 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF10P55107 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF10P55107 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF10P55107 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF10P55107 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF10P55107 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF10P55107 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF10P55107 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF10P55107 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF10P55107 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF10P55107 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF10P55107 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF10P55107 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF10P55107 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF10P55107 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF10P55107 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF10P55107 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF10P55107 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms