Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS9P46781 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS9P46781 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS9P46781 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS9P46781 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS9P46781 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS9P46781 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS9P46781 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS9P46781 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS9P46781 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS9P46781 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS9P46781 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS9P46781 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS9P46781 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS9P46781 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS9P46781 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS9P46781 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms