Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NUP62P37198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUP62P37198 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP62P37198 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP62P37198 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP62P37198 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP62P37198 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP62P37198 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP62P37198 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP62P37198 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms