Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA1P35221 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms