Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARNTP27540 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARNTP27540 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARNTP27540 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARNTP27540 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARNTP27540 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARNTP27540 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARNTP27540 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARNTP27540 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARNTP27540 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARNTP27540 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARNTP27540 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARNTP27540 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARNTP27540 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARNTP27540 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARNTP27540 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARNTP27540 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARNTP27540 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARNTP27540 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARNTP27540 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARNTP27540 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARNTP27540 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARNTP27540 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARNTP27540 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARNTP27540 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARNTP27540 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARNTP27540 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms