Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP3P21580 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP3P21580 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP3P21580 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms