Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM3P20309 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM3P20309 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms