Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA1P15085 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA1P15085 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA1P15085 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA1P15085 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA1P15085 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA1P15085 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPA1P15085 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA1P15085 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA1P15085 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA1P15085 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA1P15085 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA1P15085 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA1P15085 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA1P15085 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA1P15085 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA1P15085 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA1P15085 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA1P15085 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA1P15085 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA1P15085 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA1P15085 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA1P15085 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA1P15085 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA1P15085 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA1P15085 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA1P15085 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA1P15085 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA1P15085 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA1P15085 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA1P15085 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA1P15085 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA1P15085 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms