Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA4P12838 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA4P12838 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms