Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT3P12035 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT3P12035 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT3P12035 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT3P12035 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT3P12035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT3P12035 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT3P12035 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT3P12035 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT3P12035 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT3P12035 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT3P12035 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT3P12035 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT3P12035 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT3P12035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT3P12035 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms