Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP1P11279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP1P11279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms