Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP1P09455 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBP1P09455 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP1P09455 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP1P09455 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP1P09455 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP1P09455 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP1P09455 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP1P09455 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP1P09455 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP1P09455 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP1P09455 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP1P09455 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP1P09455 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP1P09455 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP1P09455 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP1P09455 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP1P09455 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP1P09455 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP1P09455 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms