Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLBP06746 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLBP06746 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLBP06746 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLBP06746 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLBP06746 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLBP06746 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLBP06746 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLBP06746 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLBP06746 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLBP06746 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLBP06746 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLBP06746 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLBP06746 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLBP06746 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLBP06746 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLBP06746 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLBP06746 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLBP06746 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLBP06746 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLBP06746 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms