Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB2P05107 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB2P05107 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms