Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC2P02655 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC2P02655 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC2P02655 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOC2P02655 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOC2P02655 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC2P02655 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC2P02655 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC2P02655 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC2P02655 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC2P02655 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC2P02655 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC2P02655 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC2P02655 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC2P02655 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC2P02655 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC2P02655 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC2P02655 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC2P02655 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC2P02655 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC2P02655 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC2P02655 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC2P02655 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC2P02655 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC2P02655 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC2P02655 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC2P02655 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC2P02655 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC2P02655 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC2P02655 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms